Madrasah Aliyah An-Nur berdiri dan beroperasi bersamaan dengan permulaan tahun pelajaran baru 2007/2008 tepatnya bulan Juli 2007. Ide atau gagasan pendirian MA ini telah muncul pada tahun 2005. Namun keinginan itu urung diredisasikan karena beberapa faktor, baik terkait dengan fasilitas pendidikan maupun SDM tenaga pendidik yang belum memadai serta anggaran. Tidak ada motivasi lain terhadap lahirnya MA ini selain demi semata-mata meningkatkan mutu dumber daya manusia masyarakat Giligenting sekaligus sebagai dukungan terhadap program pendidikan menengah (pendidikan 12 tahun) yang dicanangkan Pemerintah Kabupaten Sumunep.
